尤其基因组分析助力大肠杆菌进化研究

，将另设基因组簇与架构基因组灵长类树进行时比较，结果注意到另设基因组簇和架构基因组灵长类相对类似于，揭示了从里国闽粤分立得到的51株E.coli ST1193M-病原体不具备较高的遗传动植物。

布2 GO富含深入研究

毒力基因深入研究

根据毒力基因(VF)深入研究注意到，完全相同分立株间的VFs分布不存在关联。70%的E.coli ST1193基因组不具备毒力基因，如内膜血红亦同特异性基因chuA（76/76, 100%）、铁载体特异性基因fyuA（76/76, 100%）、菌毛蛋白基因yfcV（76 /76, 100%), 空泡自仓储基因 vat (76/76, 100%), 肾脏自仓储基因 sat (72/76, 94.7%), IrgA 同源粘附亦同基因 iha (71/76, 93.4%), 谷氨酸肽基因 decar gad (70/76, 92.1%) 和真核生物空投的肠毒亦同基因 senB (58/76, 76.3%)等，这些基因均可以在所有地理区域里受控到。在在的是，灵长类头花 A（非里国E.coli ST1193 分立株）和灵长类头花 B（来自里国闽粤的分立株）间的 VF 不存在很大关联，除此以外 cia、neuC、gad 和 traT。

布3 76株 E.coli ST1193M-病原体毒力位点、真核生物复制子M-式和青霉素基因热布

真核生物复制子M-式

对所有病原体进行时真核生物复制子M-式深入研究，试验中几乎所有的分立株（75/76，98.7%）都至极多空投一种真核生物复制子M-式，其里包涵19种恰当的真核生物不亲和M-式。E.coli ST1193包涵两种FM-复制子(IncFIA和IncFIB)，而IncFII复制子只能在3株病原体里受控到。本学术研究基于真核生物F等位基因进行时真核生物MLST分M-， 深入调查结果 IncFIA 等位基因 (A1) 在E.coli ST1193 里相对流行；IncFIB 等位基因是多样的，并且确认了 IncFIB 的四种完全相同等位基因（B-、B1、B10 和 B20）；Col (BS512) 和 Col156 在本学术研究里所有地理区域的分立株里相对流行。

布4 闽粤和非里国区分立株的毒力位点和真核生物复制子M-式比较

此外，灵长类头花 A（非里国病原体 ST1193 分立株）和灵长类头花 B（来自里国闽粤的分立株）间空投的真核生物复制子M-式不存在很大关联。IncQ1 在 60.9% 的非里国E.coli ST1193 里被确认，但只能在来自里国闽粤的 39.1% 分立株里被注意到（p

抗病毒持续性基因

在本学术研究里，所有E.coli ST1193M-病原体的关键基因 parC (S80I)、parE (L416F) 和 gyrA (D87N 和 S83L) 里都包涵相同的四个非同义突变，而这四个看家基因的突变时会导致氟吲哚持续性。在76株E.coli ST1193病原体里均不存在一些抗病毒外排基因和与抗病毒渗透性降低特别的基因，最极多50%的分立株包涵诱导青霉素特别基因，如blaTEM-B（60.5%）、sul2（77.6%）、dfrA17(55.3%)等。而blaCTX-M-130 和 blaCTX-M-14只能在灵长类头花 A（非里国E.coli ST1193 分立株）里受控到，tet(B) 和 tet(R)只能在灵长类头花 B（来自闽粤、里国）受控到。此外，我们判读到灵长类头花 A 和灵长类头花 B 间空投的 ARG 不存在很大关联，除此以外 blaCTX-M-55、blaTEM-1、sul2、tet(B)、tet(R)、APH(6 )-Id 和 AAC(3)-IId等。

布5 闽粤和非里国区分立株的抗病毒持续性基因比较

blaCTX-M-55 在E.coli ST1193 里不具备完全相同的遗传生存环境

blaCTX-M-55 通常在E.coli ST1193 里注意到，可能在 ST1193 论及的克隆为了将里发挥重要关键作用，这无可避免我们实质性学术研究该基因在ST1193里的遗传生存环境。本学术研究在9个分立株里注意到blaCTX-M-55基因，这些分立株均来自亚洲，其里 8 个来自里国闽粤，1 个来自泰国。从 blaCTX-M-55基因不存在的真核生物特别序列里，可以确定这些分立株和AMR基因特别。此外，注意到 blaCTX-M-55和 IncI1 和/或FIB在 55.6% 分立株的同一contig里被确认出来。在所有9个分立株里，blaCTX-M-55位于 ORF477基因的下游。同时在blaCTX-M-55 的下游或下游受控到完全相同的移动电容器，除此以外 ISEc9、Tn3 和定位肽基因；而blaTEM-1位于里国闽粤的两个分立株里 blaCTX-M-55的下游。

布6 E.coli ST1193 里 blaCTX-M-55 的遗传生存环境

学术研究推论

本学术研究为耐氟吲哚类药E.coli ST1193病原体分子海洋生物学关系包括了重要依据。学术研究试验中，E.coli ST1193在里国闽粤和非里国地区的传播轨迹完全相同，其里里国闽粤分立株却是比整个世界之内的愈发多样化。本结果是一个较好的引航深入研究，可以为实质性扩张深入研究包括一个起点。应进行时军事战略和持续性受控，以预防E.coli ST1193 引起的接种。

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